邓初民毕业回国后的五年，中国的政治形势发生了很大变化。邓初民决定到南方投身革命。到武汉不久，邓初民经董必武介绍，加入了国民党。北伐军占领南昌后，蒋介石挑起了“迁都”之争，邓初民也参加了这场斗争。他前往南昌说服蒋介石遵照孙中山意旨将国民革命进行到底，但蒋介石却不为所动。1927年3月，湖北省党部召开庆祝国民党政府迁都武汉的群众大会，邓初民发表演说批评国民党右派的分裂活动。蒋介石发动反革命政变后，邓初民十分愤怒，力主对蒋实施讨伐。汪精卫“分共”后，湖北省政府被右派掌控。不久，邓初民被列为亲共分子，难以在武汉立足，只得离开武汉来到上海。

此后，邓初民积极参加抗日救亡活动。抗战爆发后，经与共产党员张云逸面谈，邓初民北上武汉从事抗日统战活动。1946年2月，重庆较场口事件发生后，邓初民等人联名发表《告全国人民书》，揭露国民党反动派破坏和平的罪行。因遭到国民党特务暴徒的袭击，邓初民在中共地下党的帮助下，出走香港。1949年初，他同一批民主人士到达北京，9月参加了中国人民政治协商会议。

1962年，邓初民以73岁的高龄入了党，对此他非常高兴，引用苏轼“谁道人生无再少，门前流水尚能西”的名句来表达自己的激动心情。

读“邓初民：古稀之年终入党”有感

“德教传承仰良师”民盟革命先驱邓初民先生，读完他的故事，让我产生了深深的敬佩之情。邓初民先生是我国著名的社会科学家，杰出的马克思主义理论宣传家和人民教育家。他紧跟着时代的潮流，苦苦求索奋力追求，希望通过自身的努力来改变国家落后的现状，邓初民先生作为当时的先进知识分子之一，积极学习和传播马克思主义，并在自身教学著述的实践中，形成了具有其个人特色的马克思主义政治学体系,成为我国最早接触马克思主义的学者之一。当他认识到共产党是中华民族的希望，在便毅然决然地选择中国共产党渔港风雨同舟，真诚合作，六十余年完成了从民族主义者到共产主义者的转变。邓初民先生的历史证明：知识分子只有跟随中国共产党投身革命洪流，才能实现美好的追求和理想。